Цільові бюджетні фонди — відокремлена у складі бюджету частина фінансових ресурсів, яка формується відповідно до законодавства за рахунок доходів цільового призначення або в порядку цільових відрахувань від конкретних видів доходів та інших надходжень і використовується на фінансування лише тих витрат, які були визначені як ціль створення відповідного фонду. Щодо доходів цільового призначення не діє принцип загального (сукупного) покриття витрат при формуванні бюджету за рахунок загальної величини доходів, що надійшли.
Доходи цільових бюджетних фондів на відміну від решти бюджетних доходів не знеособлюються і спрямовуються на заздалегідь обумовлені цілі; використання коштів цільових бюджетних фондів на цілі, що не відповідають їхньому призначенню, не допускається. Саме тому доходи цільових бюджетних фондів обліковуються від інших бюджетних доходів. Процеси формування та використання коштів кожного з цільових бюджетних фондів відображаються в окремому кошторисі.
Цільові бюджетні фонди можуть мати або галузевий або загальнорегулюючий характер. До перших відносяться цільові бюджетні фонди, призначені для вирішення завдань якоїсь окремої галузі (наприклад, атомної енергетики, або відтворення мінерально-сировинної бази, або боротьби зі злочинністю, або розвитку податкової служби в країні тощо); до других – резервні фонди бюджету, державний (федеральний) фонд фінансової підтримки регіонів тощо.
Кількість цільових бюджетних фондів який завжди й у роки може змінюватися відповідно до цільовими установками з їхньої створення.
Міністерство (відомство), яке виступає головним розпорядником коштів цільового фонду, здійснює управління його коштами; на стадії бюджетного планування воно у порядку представляє розрахунки з формуванню фонду, і навіть перелік фінансованих рахунок коштів фонду заходів. Головний розпорядник коштів цільового фонду на основі затвердженого поквартального розподілу ліміту бюджетних зобов’язань здійснює розподіл коштів фонду між нижчими розпорядниками коштів.
Облік операцій із коштами цільових фондів федерального бюджету здійснює казначейство Міністерства фінансів, цільових фондів регіональних та місцевих бюджетів – органи, що виконують ці бюджети. Доходи та витрати цільових бюджетних фондів враховуються відповідно до чинної бюджетної класифікації. Фінансування видатків цільових бюджетних фондів здійснюється в межах доходів, визначених законом (рішенням) про бюджет на відповідний фінансовий рік.
